Алексея Матюнина неоднократно обвиняли в оскорблениях и нецензурной брани.
Летом 2005 года на Матюнина чуть не набросился вице-президент ФК «Текстильщик-Телеком». Проблема была в том, что арбитр вместо того, чтобы засчитать три гола ивановской команде, внезапно удалил одного из нападающих с поля.
Еще одной неприятной историей скандального арбитра стало обвинение в нецензурной ругани на поле, а в ноябре 2011 года его отстранили от работы на год за негативные националистические высказывания. Однако это никак не повлияло на поведение Матюнина, и в ноябре 2014-го он снова был замешан в оскорблениях на расовой почве футболиста из «Зенита».
В мае 2021 года Алексей Матюнин удалил с поля тренера ФК «Ростов» Валерия Карпина. Сначала наставник «желто-синих» спорил с арбитром из-за квалификации момента, когда защитник Деннис Хаджикадунич травмировался после столкновения с соперником. Тогда судья показал Карпину желтую карточку. Однако как только игра вновь началась, произошел еще один спорный момент у ворот «Краснодара». Арбитр не стал назначать пенальти, и тренер кинул на газон бутылку воды. После этого он получил уже красную карточку.
Напомним, матч «Ростов» - «Краснодар» состоится 13 сентября в 19:30 на стадионе «Ростов Арена».
